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Dans la lutte contre les infections, le développement et la propagation de la résistance bactérienne aux antibiotiques constituent un problème particulièrement important dans la plupart des pays. L'émergence de pneumocoques résistants à la pénicilline, d'entérocoques résistants à la vancomycine, de staphylocoques résistants à la méthicilline et même à la vancomycine, d'entérobactéries résistantes aux quinolones et de souches multirésistantes d'Acinetobacter spp ou de Pseudomonas spp, entre autres problèmes, a également tiré la sonnette d'alarme quant à une éventuelle crise mondiale des antibiotiques.

Un autre défi, de ces dernières années et lié aux maladies infectieuses, est l'émergence de plusieurs nouvelles maladies à forte morbidité, ce qui nécessite un niveau important de mise à jour.

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Module 1. L'épidémiologie et la microbiologie des maladies infectieuses

1.1. Conditions épidémiologiques, économiques et sociales par continent qui favorisent le développement des maladies infectieuses

1.1.1. Afrique
1.1.2. Amérique
1.1.3. Europe et Asie

1.2. Maladies nouvelles et émergentes par continent

1.2.1. Morbidité et mortalité dues aux maladies infectieuses en Afrique
1.2.2. Morbidité et mortalité dues aux maladies infectieuses en Amérique
1.2.3. Morbidité et mortalité dues aux maladies infectieuses en Asie
1.2.4. Morbidité et mortalité dues aux maladies infectieuses en Europe

1.3. La taxinomie des agents infectieux

1.3.1. Les virus
1.3.2. Les bactéries
1.3.3. Les champignons
1.3.4. Les parasites

1.4. Les propriétés pathogènes des micro-organismes pour produire les maladies

1.4.1. Mécanismes de la pathogénicité
1.4.2. Mécanismes d'adhésion et de multiplication
1.4.3. Mécanismes permettant l'acquisition de nutriments auprès de l'hôte
1.4.4. Mécanismes inhibant le processus phagocytaire
1.4.5. Mécanismes d'évasion de la réponse immunitaire

1.5. Microscopie et coloration

1.5.1. Microscopes et types de microscopie
1.5.2. Taches composites
1.5.3. Coloration des micro-organismes acido-basiques
1.5.4. Des colorants pour mettre en évidence les structures cellulaires

1.6. Cultures et croissance des micro-organismes

1.6.1. Milieux de culture généraux
1.6.2. Milieux de culture spécifiques

1.7. Effet des agents chimiques et physiques sur les micro-organismes

1.7.1. Stérilisation et désinfection
1.7.2. Désinfectants et antiseptiques utilisés dans la pratique

1.8. La biologie moléculaire et son importance pour l'infectiologue

1.8.1. Génétique bactérienne
1.8.2. Tests de réaction en chaîne par polymérase

1.9. Indication et interprétation des études microbiologiques

Module 2. Maladies hémorragiques virales et arbovirus

2.1. Maladies virales hémorragiques

2.1.1. Épidémiologie
2.1.2. Classification
2.1.3. Approche diagnostique des maladies hémorragiques virales
2.1.4. Le développement de vaccins pour ces maladies
2.1.5. Mesures de lutte contre les maladies hémorragiques virales

2.2. Fièvre hémorragique Ebola

2.2.1. Caractéristiques et cycle de réplication du virus
2.2.2. Tableau clinique
2.2.3. Diagnostic
2.2.4. Traitement

2.3. Fièvres hémorragiques d'Amérique du Sud

2.3.1. Caractéristiques du virus et cycle de réplication
2.3.2. Tableau clinique
2.3.3. Diagnostic
2.3.4. Traitement

2.4. Arbovirosis

2.4.1. Épidémiologie
2.4.2. Contrôle des vecteurs
2.4.3. Autres arbovirus

2.5. Fièvre Jaune

2.5.1. Concept
2.5.2. Cycle de réplication du virus
2.5.3. Manifestations cliniques
2.5.4. Diagnostic
2.5.5. Traitement

2.6. Fièvre de la dengue

2.6.1. Concept
2.6.2. Cycle de réplication du virus
2.6.3. Manifestations cliniques
2.6.4. Diagnostic
2.6.5. Traitement

2.7. Virus Chikungunya

2.7.1. Concept
2.7.2. Cycle de réplication du virus
2.7.3. Manifestations cliniques
2.7.4. Diagnostic
2.7.5. Traitement

2.8. Zika.

2.8.1. Concept
2.8.2. Cycle de réplication du virus
2.8.3. Manifestations cliniques
2.8.4. Diagnostic
2.8.5. Traitement

Module 3. Zoonoses

3.1. Généralités sur les zoonoses

3.1.1. Concepts généraux et épidémiologie des zoonoses
3.1.2. Principales zoonoses internationales
3.1.3. Zoonoses causées par les prions
3.1.4. Les prions dans l'étiologie des maladies
3.1.5. Encéphalopathie spongiforme bovine (ou maladie de la vache folle)
3.1.6. Principales mesures de contrôle des zoonoses

3.2. Rage

3.2.1. Épidémiologie
3.2.2. Agent infectieux
3.2.3. Pathobiologie
3.2.4. Tableau clinique
3.2.5. Diagnostic
3.2.6. Traitement

3.3. La grippe aviaire

3.3.1. Épidémiologie
3.3.2. Agent infectieux
3.3.3. Pathobiologie
3.3.4. Tableau clinique
3.3.5. Diagnostic
3.3.6. Traitement

3.4. Leptospirose

3.4.1. Épidémiologie
3.4.2. Agent infectieux
3.4.3. Pathobiologie
3.4.4. Tableau clinique
3.4.5. Diagnostic
3.4.6. Traitement

3.5. Brucellose

3.5.1. Épidémiologie
3.5.2. Agent infectieux
3.5.3. Pathobiologie
3.5.4. Tableau clinique
3.5.5. Diagnostic
3.5.6. Traitement

3.6. Toxoplasmose

3.6.1. Épidémiologie
3.6.2. Agent infectieux
3.6.3. Pathobiologie
3.6.4. Tableau clinique
3.6.5. Diagnostic
3.6.6. Traitement

Module 4. Maladies infectieuses rares et autres défis en infectiologie

4.1. Aperçu général des maladies infectieuses rares

4.1.1. Concepts généraux
4.1.2. Épidémiologie des maladies infectieuses rares

4.2. La peste bubonique

4.2.1. Définition
4.2.2. Étiologie
4.2.3. Tableau clinique
4.2.4. Diagnostic
4.2.5. Traitement

4.3. Maladie de Lyme 

4.3.1. Définition
4.3.2. Étiologie
4.3.3. Tableau clinique
4.3.4. Diagnostic
4.3.5. Traitement

4.4. La babésiose

4.4.1. Définition
4.4.2. Étiologie
4.4.3. Tableau clinique
4.4.4. Diagnostic
4.4.5. Traitement

4.5. La fièvre de la vallée du Rift

4.5.1. Définition
4.5.2. Étiologie
4.5.3. Tableau clinique
4.5.4. Diagnostic
4.5.5. Traitement

4.6. La diphyllobothriasis

4.6.1. Définition
4.6.2. Étiologie
4.6.3. Tableau clinique
4.6.4. Diagnostic
4.6.5. Traitement

4.7. La Zygomycose

4.7.1. Définition
4.7.2. Étiologie
4.7.3. Tableau clinique
4.7.4. Diagnostic
4.7.5. Traitement

4.8. La Cysticercose

4.8.1. Définition
4.8.2. Étiologie
4.8.3. Tableau clinique
4.8.4. Diagnostic
4.8.5. Traitement

4.9. Kuru

4.9.1. Définition
4.9.2. Étiologie
4.9.3. Tableau clinique
4.9.4. Diagnostic
4.9.5. Traitement

Les défis des maladies infectieuses:

4.10. Réapparition d'anciennes maladies: causes et effets

4.10.1. Maladies infectieuses nouvelles et émergentes nécessitant de nouvelles approches dans la lutte contre celles-ci
4.10.2. L'augmentation de la résistance microbiologique aux médicaments antimicrobiens
4.10.3. Le développement de nouveaux antibiotiques

Module 5. Accident du travail et agents pathogènes transmissibles par le sang

5.1. Épidémiologie des infections par des agents pathogènes transmissibles par le sang
5.2. Principales infections transmises par le sang

5.2.1. Infection par le virus de l'hépatite B
5.2.2. Infection par le virus de l'hépatite C
5.2.3. VIH/SIDA

5.3. Approche diagnostique et thérapeutique des accidents impliquant le sang

5.3.1. Suivi diagnostique des cas
5.3.2. Traitement

5.4. Les précautions universelles dans la prévention des accidents du travail
5.5. Mesures de biosécurité et rôle de l'épidémiologiste dans la réduction des risques biologiques

5.5.1. Risque biologique
5.5.2. Biosécurite
5.5.3. Plans de biosécurité pour la protection biologique

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