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As doenças infeciosas continuam a ser a principal causa de mortalidade e incapacidade (perda de anos de vida produtiva) no mundo. Em 2016, do total de 56,4 milhões de mortes em todo o mundo, 33% deveram-se a doenças infeciosas, 30% a doenças cardiovasculares e 10% ao cancro. A luta contra a doença terá duas frentes simultâneas: doenças infeciosas e doenças crónicas não transmissíveis. 

Estes fatores, interagindo uns com os outros, significam que não devemos considerar qualquer parte do planeta razoavelmente isolada do resto, nem o aparecimento, reaparição ou propagação de doenças infeciosas importadas ou aparentemente erradicadas do nosso ambiente, como sendo impossíveis.

A complexa situação epidemiológica internacional vivida até à data neste século, de que são exemplo a libertação deliberada de esporos de Bacillus anthracis como arma de bioterrorismo para provocar antraz pulmonar nas vítimas que os inalaram, a emergência do vírus do Nilo Ocidental como agente patogénico nos Estados Unidos, a epidemia de Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS), a propagação zoonótica da varíola do macaco nos Estados Unidos, a ameaça de uma gripe pandémica, a epidemia de Ébola em África, o aparecimento de casos de febre amarela em Angola, juntamente com o reaparecimento da dengue e da cólera, o surgimento de novas arboviroses na região das Américas, como o Chikingunya e, mais recentemente, o Zika, juntamente com a morbilidade de outras doenças infeciosas endémicas, como o HIV/SIDA, a leptospirose, a tuberculose, a pneumonia adquirida na comunidade e o aumento da resistência aos antibióticos com o desenvolvimento de bactérias multirresistentes. Todos estes fatores evidenciam a necessidade sem precedentes de melhorar o processo de formação e desenvolvimento do capital humano, a fim de aumentar a competência e o desempenho de todo o pessoal necessário para enfrentar os desafios de controlar e lidar com emergências biológicas, hospitalares e de saúde pública que garantam a qualidade e a segurança dos cuidados de saúde prestados à população em qualquer parte do mundo. 

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Módulo 1.  Diagnóstico microbiológico e outros exames para doenças infeciosas

1.1. Organização, estrutura e funcionamento do laboratório de microbiologia

1.1.1. Organização e estrutura do laboratório de microbiologia
1.1.2. Funcionamento de um laboratório de microbiologia

1.2. Princípios da utilização de exames microbiológicos em doentes com patologias infeciosas O processo de amostragem

1.2.1. O papel dos estudos microbiológicos no diagnóstico das doenças infeciosas
1.2.2. O processo de amostragem microbiológica: fase pré-analítica, analítica e pós-analítica
1.2.3. Requisitos de amostragem para os principais estudos microbiológicos utilizados na atividade clínica diária: estudos de sangue, urina, fezes, expetoração

1.3. Estudos virológicos

1.3.1. Tipos de vírus e suas características gerais
1.3.2. Características gerais de estudos virológicos
1.3.3. Cultura viral
1.3.4. Estudos do genoma viral
1.3.5. Os estudos de antigénios e anticorpos contra vírus

1.4. Estudos bacteriológicos

1.4.1. Classificação das bactérias
1.4.2. Características gerais de estudos virológicos
1.4.3. Manchas para a identificação de bactérias
1.4.4. O estudo dos antigénios bacterianos
1.4.5. Métodos de cultivo: geral e específico
1.4.6. Bactérias que requerem métodos de estudo especiais

1.5. Estudos virológicos

1.5.1. Classificação dos fungos
1.5.2. Principais estudos micológicos

1.6. Estudos parasitológicos

1.6.1. Classificação dos parasitas
1.6.2. Estudos para protozoários
1.6.3. Estudos para helmintos

1.7. Interpretação adequada dos estudos microbiológicos

1.7.1. Inter-relação microbiológica clínica para a interpretação de estudos microbiológicos

1.8. A leitura interpretada do antibiograma

1.8.1. Interpretação tradicional do antibiograma em relação à suscetibilidade e resistência antimicrobiana
1.8.2. A leitura interpretada do antibiograma: atual

1.9. Utilidade do mapa microbiano de uma instituição

1.9.1. Qual é o mapa microbiano de uma instituição? 
1.9.2. Aplicabilidade clínica do mapa microbiano

1.10. Biossegurança

1.10.1. Definições concetuais de biossegurança
1.10.2. Importância da biossegurança para os serviços de saúde
1.10.3. Medidas de precaução universais
1.10.4. Gestão de resíduos biológicos numa instituição de cuidados de saúde

1.11. Epidemiologia no estudo das doenças infeciosas

1.11.1. Reagentes de fase aguda
1.11.2. Estudos do fígado, ambiente interno, coagulação e função renal na septicemia
1.11.3. O estudo de fluidos inflamatórios no diagnóstico de infeções
1.11.4. Biomarcadores, utilidade na prática clínica

1.12. Estudos de imagem para o diagnóstico de patologia infeciosa

1.12.1. O papel dos estudos imagiológicos em doentes com doenças infeciosas
1.12.2. O papel da ecografia na avaliação global do doente com septicemia

1.13. O papel de estudos genéticos e imunológicos

1.13.1. Estudos de doenças genéticas e a sua predisposição para doenças infeciosas
1.13.2. Estudos imunológicos em doentes imunodeprimidos

1.14. Utilidade dos estudos de patologia anatómica

1.14.1. Alterações nos estudos citológicos de acordo com o tipo de agente biológico
1.14.2. A necropsia e a sua importância na mortalidade infeciosa

1.15. Avaliação da gravidade das doenças infeciosas

1.15.1. Escalas prognósticas no tratamento de doentes com patologias infeciosas baseadas em estudos laboratoriais e características clínicas
1.15.2. SOFA, utilidade hoje em dia: componentes do SOFA, o que ele mede Utilidade na avaliação dos doentes
1.15.3. Principais complicações das doenças infeciosas

1.16. Campanha global contra a septicemia

1.16.1. Surgimento e evolução
1.16.2. Objetivos
1.16.3. Recomendações e impactos

1.17. Bioterrorismo

1.17.1. Principais agentes infeciosos utilizados para bioterrorismo
1.17.2. Regulamentos internacionais sobre o manuseamento de amostras biológicas

Módulo 2. Doenças bacterianas e antibióticos

2.1. Princípios de bacteriologia

2.1.1. Conceitos fundamentais para uso em bacteriologia
2.1.2. Principais bactérias gram-positivas e suas doenças
2.1.3. Principais bactérias gram-negativas e suas doenças

2.2. Infeções bacterianas da pele

2.2.1. Foliculite
2.2.2. Furunculose
2.2.3. Antrax
2.2.4. Abcessos superficiais
2.2.5. Erisipela

2.3. Pneumonia adquirida na comunidade

2.3.1. Epidemiologia
2.3.2. Etiologia
2.3.3. Quadro clínico
2.3.4. Diagnóstico
2.3.5. Escalas prognósticas
2.3.6. Tratamento

2.4. Tuberculose

2.4.1. Epidemiologia
2.4.2. Etiopatogenia
2.4.3. Manifestações clínicas
2.4.4. Classificação
2.4.5. Diagnóstico
2.4.6. Tratamento

2.5. Infeções do trato urinário e ginecológicas nas mulheres

2.5.1. Classificação
2.5.2. Etiologia
2.5.3. Quadro clínico
2.5.4. Diagnóstico
2.5.5. Tratamento

2.6. Meningite bacteriana

2.6.1. Imunologia do espaço subaracnoídeo
2.6.2. Etiologia
2.6.3. Quadro clínico e complicações
2.6.4. Diagnóstico
2.6.5. Tratamento

2.7. infeções osteoarticulares

2.7.1. Artrite séptica
2.7.2. Osteomielite
2.7.3. Miosite infeciosa

2.8. Infeções entéricas e intra-abdominais

2.8.1. Gastroenterite aguda
2.8.2. Enterocolite aguda
2.8.3. Peritonite primária
2.8.4. Peritonite secundária

2.9. Zoonose

2.9.1. Conceito
2.9.2. Epidemiologia
2.9.3. Zoonoses principais
2.9.4. Leptospirose

2.10. Antibacterianos

2.10.1. Conceitos gerais
2.10.2. Classificações
2.10.3. Mecanismos de ação dos antibióticos

2.11. Betalactâmicos: penicilinas e inibidores de betalactamase

2.11.1. Estrutura do anel de beta-lactam
2.11.2. Penicilinas: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.11.3. Betalactamases: tipos e ação sobre antibióticos betalactâmicos
2.11.4. Principais inibidores da betalactamase
2.11.5. Usos e indicações terapêuticas
2.11.6. Cefalosporinas
2.11.7. Monobactâmicos
2.11.8. Carbapenéns

2.12. Aminoglicosídeos, Tetraciclinas e Glicopeptídeos

2.12.1. Aminoglicosídeos: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.12.2. Tetraciclinas: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.12.3. Glicopeptídeos: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação

2.13. Lincosaminas, rifampicinas, antifolatos

2.13.1. Lincosaminas: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação.
2.13.2. Rifampicinas: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.13.3. Antifolatos: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação

2.14. Quinolonas, Macrolídeos e Cetolídeos

2.14.1. Quinolonas: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.14.2. Macrolídeos: classificação, mecanismos de ação, espectro antibiótico, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação
2.14.3. Cetolídeos: classificação, mecanismos de ação, espetro antimicrobiano, farmacocinética, farmacodinâmica, dosagem e apresentação

2.15. Novos antibióticos nas infeções por Gram-positivos (lipopeptídeos e oxazolidinonas)

2.15.1. Lipopeptídeos
2.15.2. Oxazolidinonas

Módulo 3. Doenças fúngicas

3.1. Introdução à micologia e às infeções fúngicas superficiais

3.1.1. Conceitos gerais utilizados em micologia
3.1.2. Características-chave dos fungos patogénicos
3.1.3. Infeções fúngicas superficiais: Epidermofitose Tinea Corporis Tinea Capitis

3.2. Infeções fúngicas profundas

3.2.1. As micoses profundas mais comuns
3.2.2. Principais manifestações clínicas de micoses profundas

3.3. Criptococose

3.3.1. Epidemiologia
3.3.2. Agentes etiológicos
3.3.3. Patogenia
3.3.4. Quadro clínico
3.3.5. Complicações
3.3.6. Diagnóstico
3.3.7. Tratamento

3.4. Histoplasmose

3.4.1. Epidemiologia
3.4.2. Agentes etiológicos
3.4.3. Patogenia
3.4.4. Quadro clínico
3.4.5. Complicações
3.4.6. Diagnóstico
3.4.7. Tratamento

3.5. Aspergilose

3.5.1. Epidemiologia
3.5.2. Agentes etiológicos
3.5.3. Patogenia
3.5.4. Quadro clínico
3.5.5. Complicações
3.5.6. Diagnóstico
3.5.7. Tratamento

3.6. Candidíase sistémica

3.6.1. Epidemiologia
3.6.2. Agentes etiológicos
3.6.3. Patogenia
3.6.4. Quadro clínico
3.6.5. Complicações
3.6.6. Diagnóstico
3.6.7. Tratamento

3.7. Coccidioidomicose

3.7.1. Epidemiologia
3.7.2. Agentes etiológicos
3.7.3. Patogenia
3.7.4. Quadro clínico
3.7.5. Complicações
3.7.6. Diagnóstico
3.7.7. Tratamento

3.8. Blastomicose

3.8.1. Epidemiologia
3.8.2. Agentes etiológicos
3.8.3. Patogenia
3.8.4. Quadro clínico
3.8.5. Complicações
3.8.6. Diagnóstico
3.8.7. Tratamento

3.9. Esporotricose

3.9.1. Epidemiologia
3.9.2. Agentes etiológicos
3.9.3. Patogenia
3.9.4. Quadro clínico
3.9.5. Complicações
3.9.6. Diagnóstico
3.9.7. Tratamento

Módulo 4. . Doenças parasitárias e tropicais

4.1. Introdução à parasitologia

4.1.1. Conceitos gerais utilizados em parasitologia
4.1.2. Epidemiologia das principais parasitoses e doenças tropicais
4.1.3. Classificação dos parasitas
4.1.4. Doenças Tropicais e Síndrome Febril nos Trópicos

4.2. Malária

4.2.1. Epidemiologia
4.2.2. Agentes etiológicos
4.2.3. Patogenia
4.2.4. Quadro clínico
4.2.5. Complicações
4.2.6. Diagnóstico
4.2.7. Tratamento

4.3. Doenças protozoárias intestinais

4.3.1. Protozoários intestinais principais
4.3.2. Diagnóstico de protozoários intestinais
4.3.3. Amebíase e Giardíase

4.4. Doenças filárias

4.4.1. Epidemiologia e situação global
4.4.2. Síndromes clínicas
4.4.3. Filarias principais: Wuchereria bancrofti, Brugia malayi, Brugia timori, Onchocerca volvulus, Loa loa, Mansonella perstans, Mansonella streptocerca e Mansonella ozzardi

4.5. Leishmaniose

4.5.1. Leishmaniose cutânea
4.5.2. Leishmaniose profunda

4.6. Tripanossomíase

4.6.1. Tripanossomíase africana
4.6.2. Tripanossomíase americana

4.7. Esquistossomose

4.7.1. Esquistossomose haematobium
4.7.2. Esquistossomose mansoni
4.7.3. Esquistossomose japonicum

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