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Module 1. Recherche Clinique sur les maladies infectieuses  

1.1. La méthode clinique dans le processus de diagnostic des maladies infectieuses 

1.1.1. Concepts fondamentaux de la méthode clinique: étapes et principes 
1.1.2. La méthode clinique et son utilité dans les maladies infectieuses 
1.1.3. Erreurs les plus fréquentes dans l'application de la méthode clinique 

1.2. L'épidémiologie dans l'étude des maladies infectieuses 

1.2.1. L'épidémiologie en tant que science 
1.2.2. La méthode épidémiologique 
1.2.3. Outils épidémiologiques appliqués à l'étude des maladies infectieuses 

1.3. Épidémiologie clinique et médecine fondée sur les preuves 

1.3.1. Preuves scientifiques et expérience clinique 
1.3.2. L'importance de la médecine fondée sur des preuves dans le diagnostic et le traitement 
1.3.3. L'épidémiologie clinique, une arme puissante de la pensée médicale 

1.4. Comportement des maladies infectieuses dans la population 

1.4.1. Endémie 
1.4.2. Épidémie 
1.4.3. Pandémie 

1.5. Faire face aux épidémies 

1.5.1. Diagnostic des épidémies 
1.5.2. Mesures de lutte contre les épidémies 

1.6. Surveillance épidémiologique 

1.6.1. Types de surveillance épidémiologique 
1.6.2. Conception des systèmes de surveillance épidémiologique 
1.6.3. Utilité et importance de la surveillance épidémiologique 

1.7. Contrôle Sanitaire International 

1.7.1. Composants du Contrôle Sanitaire International 
1.7.2. Maladies soumises au Contrôle Sanitaire International 
1.7.3. Importance du Contrôle Sanitaire International 

1.8. Les systèmes de déclaration obligatoire des maladies infectieuses 

1.8.1. Caractéristiques des maladies soumises à déclaration obligatoire 
1.8.2. Rôle du médecin dans les systèmes de déclaration obligatoire des maladies infectieuses 

1.9. Vaccination 

1.9.1. Base immunologique de la vaccination 
1.9.2. Développement et production de vaccins 
1.9.3. Maladies évitables par la vaccination 
1.9.4. Expériences et résultats du système de vaccination à Cuba 

1.10. Méthodologie de recherche dans le domaine de la santé 

1.10.1. L'importance de la méthodologie de recherche en tant que science pour la Santé Publique 
1.10.2. La pensée scientifique dans le domaine de la santé 
1.10.3. La méthode scientifique 
1.10.4. Les étapes de la recherche scientifique 

1.11. Gestion de l'information et utilisation des nouvelles technologies informatiques et de communication 

1.11.1. L'utilisation des nouvelles technologies de l'information et de la communication dans la gestion des connaissances pour les professionnels de la santé dans leur travail clinique, d'enseignement et de recherche 
1.11.2. Maîtrise de l'information 

1.12. Conception d'études de recherche sur les maladies infectieuses 

1.12.1. Types d'études dans le domaine de la santé et des sciences médicales 
1.12.2. Conception de la recherche appliquée aux maladies infectieuses 

1.13. Statistiques descriptives et inférentielles 

1.13.1. Mesures de synthèse pour les différentes variables d’une recherche scientifique 
1.13.2. Mesures de la tendance centrale: moyenne, mode et médiane 
1.13.3. Mesures de la dispersion: variance et écart-type 
1.13.4. Estimation statistique 
1.13.5. Population et échantillon 
1.13.6. Outils de statistiques inférentielles 

1.14. Conception et utilisation de bases de données 

1.14.1. Types de la base de données 
1.14.2. Logiciels et progiciels statistiques pour la gestion des bases de données 

1.15. Le protocole de recherche scientifique 

1.15.1. Composantes du protocole de recherche scientifique 
1.15.2. Utilité du protocole de recherche scientifique 

1.16. Essais cliniques et méta-analyses 

1.16.1. Types d'essais cliniques 
1.16.2. Le rôle de l'essai clinique dans la recherche en santé 
1.16.3. La méta-analyse: définitions conceptuelles et leur conception méthodologique 
1.16.4. Applicabilité des méta-analyses et leur rôle dans les sciences médicales 

1.17. Lecture critique de la recherche scientifique 

1.17.1. Les revues médicales, leur rôle dans la diffusion de l'information scientifique 
1.17.2. Les revues médicales ayant le plus fort impact au niveau mondial dans le domaine de l'infectiologie 
1.17.3. Outils méthodologiques pour la lecture critique de la littérature scientifique 

1.18. Publication des résultats de la recherche scientifique 

1.18.1. L’article scientifique 
1.18.2. Types d'articles scientifiques 
1.18.3. Exigences méthodologiques pour la publication des résultats de la recherche scientifique 
1.18.4. Le processus de publication scientifique dans les revues médicales 

Module 2. Diagnostic microbiologique et autres tests pour les maladies infectieuses 

2.1. Organisation, structure et fonctionnement du laboratoire de microbiologie 

2.1.1. Organisation et structure du laboratoire de microbiologie 
2.1.2. Fonctionnement d'un laboratoire de microbiologie 

2.2. Principes d'utilisation des examens microbiologiques chez les patients atteints de pathologies infectieuses Le processus d'échantillonnage 

2.2.1. Le rôle des études microbiologiques dans le diagnostic des maladies infectieuses 
2.2.2. Le processus de collecte des échantillons microbiologiques: étapes pré-analytiques, analytiques et post-analytiques 
2.2.3. Exigences d'échantillonnage pour les principales études microbiologiques utilisées dans la pratique clinique quotidienne: études du sang, de l'urine, des selles,de la salive 

2.3. Études virologiques 

2.3.1. Les types de virus et leurs caractéristiques générales 
2.3.2. Caractéristiques générales des études virologiques 
2.3.3. Culture virale 
2.3.4. Études du génome viral 
2.3.5. Études sur les antigènes et les anticorps contre les virus 

2.4. Études bactériologiques 

2.4.1. Classification des bactéries 
2.4.2. Caractéristiques générales des études bactériologiques 
2.4.3. Colorants pour l'identification des bactéries 
2.4.4. L'étude des antigènes bactériens 
2.4.5. Méthodes de culture: générales et spécifiques 
2.4.6. Bactéries nécessitant des méthodes d'étude spéciales 

2.5. Études mycologiques 

2.5.1. Classification des champignons 
2.5.2. Principales études mycologiques 

2.6. Études parasitologiques 

2.6.1. Classification des parasites 
2.6.2. Études sur les protozoaires 
2.6.3. Études sur les helminthes 

2.7. Interprétation correcte des études microbiologiques 

2.7.1. Relation entre la microbiologie clinique et l'interprétation des études microbiologiques 

2.8. Lecture interprétée de l'antibiogramme 

2.8.1. Interprétation traditionnelle de l'antibiogramme en relation avec la sensibilité aux antimicrobiens et la résistance aux antimicrobiens 
2.8.2. Lecture interprétée de l'antibiogramme: paradigme actuel 

2.9. Utilité de la carte microbienne d'une institution 

2.9.1. Quelle est la carte microbienne d'une institution? 
2.9.2. Applicabilité clinique de la carte microbienne 

2.10. Biosécurité 

2.10.1. Définitions conceptuelles de la biosécurité 
2.10.2. Pertinence de la biosécurité pour les services de santé 
2.10.3. Mesures de précaution universelles 
2.10.4. Gestion des déchets biologiques dans un établissement de soins de santé 

2.11. Le laboratoire clinique dans l'étude des maladies infectieuses 

2.11.1. Réacteurs de phase aiguë 
2.11.2. Études de la fonction hépatique, du milieu interne, de la coagulation et de la fonction rénale dans le sepsis 
2.11.3. L'étude des fluides inflammatoires dans le diagnostic des infections 
2.11.4. Biomarqueurs, utilité en pratique clinique 

2.12. Études d'imagerie pour le diagnostic de la pathologie infectieuse 

2.12.1. Le rôle des études d'imagerie chez les patients atteints de maladies infectieuses 
2.12.2. Le rôle de l'échographie dans l'évaluation complète du patient atteint de sepsis 

2.13. Le rôle des études génétiques immunologiques 

2.13.1. Études des maladies génétiques et de leur prédisposition aux maladies infectieuses 
2.13.2. Études immunologiques chez les patients immunodéprimés 

2.14. Utilité des études d'anatomie pathologique 

2.14.1. Modifications des études cytologiques en fonction du type d'agent biologique 
2.14.2. La nécropsie et son importance dans la mortalité infectieuse 

2.15. Évaluation de la gravité des maladies infectieuses 

2.15.1. Échelles de pronostic dans la prise en charge des patients atteints de maladies infectieuses basées sur des études de laboratoire et des éléments cliniques 
2.15.2. SOFA, utilité aujourd'hui: composantes du SOFA, ce qu'il mesure Utilité pour l'évaluation des patients 
2.15.3. Principales complications des maladies infectieuses 

2.16. Campagne Mondiale contre la Sepsis 

2.16.1. Émergence et évolution 
2.16.2. Objectifs 
2.16.3. Recommandations et impacts 

2.17. Bioterrorisme 

2.17.1. Principaux agents infectieux utilisés pour le bioterrorisme 
2.17.2. Réglementation internationale sur la manipulation des spécimens biologiques 

Module 3. Le système immunitaire et les infections chez l'hôte immunodéprimé 

3.1. Structure et développement du système immunitaire 

3.1.1. Composition et développement du système immunitaire 
3.1.2. Organes du système immunitaire 
3.1.3. Cellules du système immunitaire 
3.1.4. Médiateurs chimiques du système immunitaire 

3.2. Réponse immunitaire aux infections virales et bactériennes 

3.2.1. Principales cellules impliquées dans la réponse immunitaire contre les virus et les bactéries 
3.2.2. Principaux médiateurs chimiques 

3.3. Réponse immunitaire aux infections fongique et parasitaires 

3.3.1. Réponse immunitaire contre les champignons filamenteux et les levures 
3.3.2. Réponse immunitaire contre les protozoaires 
3.3.3. Réponse immunitaire contre les helminthes 

3.4. Manifestations cliniques les plus courantes de l'immunosuppression 

3.4.1. Types d'immunosuppression 
3.4.2. Manifestations cliniques en fonction des agents infectieux 
3.4.3. Infections courantes selon le type d'immunosuppression 
3.4.4. Infections fréquentes chez les patients immunodéprimés en fonction du système organique concerné 

3.5. Syndrome fébrile chez les patients neutropéniques 

3.5.1. Manifestations cliniques les plus fréquentes 
3.5.2. Agents infectieux les plus couramment diagnostiqués 
3.5.3. Études complémentaires les plus couramment utilisées dans l'évaluation complète du patient neutropénique fébrile 
3.5.4. Recommandations thérapeutiques 

3.6. Prise en charge des patients immunodéprimés présentant une septicémie 

3.6.1. Évaluation du diagnostic, du pronostic et du traitement selon les dernières recommandations internationales étayées par des preuves scientifiques 

3.7. Traitement immunomodulateur et immunosuppresseur 

3.7.1. Immunomodulateurs, leur utilisation clinique 
3.7.2. Immunosuppresseurs, leur relation avec la septicémie 

Module 4. Éléments généraux des maladies infectieuses 

4.1. Concepts généraux et fondamentaux du processus maladies infectieuses-santé 

4.1.1. Les étapes du processus infectieux 
4.1.2. La réponse inflammatoire systémique 
4.1.3. La septicémie 
4.1.4. Complications de la septicémie 

4.2. Symptômes et signes les plus courants chez les patients atteints de maladies infectieuses 

4.2.1. Symptômes et signes locaux de la septicémie 
4.2.2. Symptômes et signes systémiques de la septicémie 

4.3. Principaux syndromes infectieux 

4.3.1. Syndromes systémiques 
4.3.2. Syndromes locaux 

4.4. Fièvre d'origine inconnue (FUO) 

4.4.1. FUO classique 
4.4.2. FOD nosocomiale 
4.4.3. FUO chez les immunodéprimés 
4.4.4. FUO et infection par le VIH 

4.5. Fièvre et éruption cutanée 

4.5.1. Types d'exanthème 
4.5.2. Principaux agents infectieux à l'origine de l'exanthème 

4.6. Fièvre et adénomégalie 

4.6.1. Caractéristiques de l'adénomégalies infectieuses 
4.6.2. Infections et adénomégalies localisées 
4.6.3. Infections et adénomégalies généralisées 

4.7. Infections sexuellement transmissibles (IST) 

4.7.1. Épidémiologie des IST 
4.7.2. Principaux agents sexuellement transmissibles 
4.7.3. Approche syndromique des IST 

4.8. Choc septique 

4.8.1. Épidémiologie 
4.8.2. Physiopathologie 
4.8.3. Manifestations cliniques et caractéristiques distinctives des autres types de chocs 
4.8.4. Diagnostic et évaluation de la gravité et des complications 
4.8.5. Prise en charge thérapeutique 

Module 5. Maladies virales et antivirales 

5.1. Principes de la virologie 

5.1.1. Épidémiologie des infections virales 
5.1.2. Concepts fondamentaux dans l'étude des virus et de leurs maladies 
5.1.3. Principaux virus affectant l'homme 

5.2. Maladies hémorragiques virales 

5.2.1. Épidémiologie 
5.2.2. Classification 
5.2.3. Fièvres hémorragiques africaines 
5.2.4. Fièvres hémorragiques d'Amérique du Sud 
5.2.5. Autres fièvres hémorragiques 

5.3. Arbovirose 

5.3.1. Concepts généraux et épidémiologie des arbovirus 
5.3.2. Dengue 
5.3.3. Fièvre jaune 
5.3.4. Chikungunya 
5.3.5. Virus Zika 
5.3.6. Autres arbovirus 

5.4. Maladies herpétiques

5.4.1. Herpès simplex 
5.4.2. Herpès Zoster 

5.5. Maladies virales exanthémateuses 

5.5.1. Rubéole 
5.5.2. Rougeole 
5.5.3. Varicelle 
5.5.4. Variole 
5.5.5. Autres maladies exanthémateuses 

5.6. Hépatite virale 

5.6.1. Infections virales non spécifiques 
5.6.2. Virus hépatotropes 
5.6.3. Hépatite virale aiguë 
5.6.4. Hépatite virale chronique 

5.7. Mononucléose infectieuse 

5.7.1. Épidémiologie 
5.7.2. Agent étiologique 
5.7.3. Pathogénie 
5.7.4. Tableau clinique 
5.7.5. Complications 
5.7.6. Diagnostic 
5.7.7. Traitement 

5.8. Rage humaine 

5.8.1. Épidémiologie 
5.8.2. Agent étiologique 
5.8.3. Pathogénie 
5.8.4. Tableau clinique 
5.8.5. Complications 
5.8.6. Diagnostic 
5.8.7. Traitement 

5.9. Encéphalite virale 

5.9.1. Encéphalite virale non herpétique 
5.9.2. Encéphalite virale herpétique 
5.9.3. Encéphalite à virus lent 

5.10. Antiviraux 

5.10.1. Concepts généraux 
5.10.2. Principales définitions relatives aux antiviraux 
5.10.3. Classification 
5.10.4. Mécanismes d'action 

5.11. Principaux antiviraux de l'herpèsvirus 

5.11.1. Mécanismes d'action 
5.11.2. Spectre antiviral 
5.11.3. Pharmacocinétique et pharmacodynamique 
5.11.4. Dosage et présentation 

5.12. Principaux antiviraux pour les infections respiratoires 

5.12.1. Mécanismes d'action 
5.12.2. Spectre antiviral 
5.12.3. Pharmacocinétique et pharmacodynamique 
5.12.4. Dosage et présentation 

5.13. Principaux antiviraux de l'hépatite 

5.13.1. Mécanismes d'action 
5.13.2. Spectre antiviral 
5.13.3. Pharmacocinétique et pharmacodynamique 
5.13.4. Dosage et présentation 

Module 6. Le point sur les infections à coronavirus 

6.1. Découverte et évolution du coronavirus 

6.1.1. Découverte du coronavirus 
6.1.2. Évolution mondiale des infections à coronavirus 

6.2. Principales caractéristiques microbiologiques et membres de la famille des coronavirus 

6.2.1. Caractéristiques microbiologiques générales des coronavirus 
6.2.2. Génome viral 
6.2.3. Principaux facteurs de virulence 

6.3. Évolution épidémiologique des infections à coronavirus depuis leur découverte jusqu'à aujourd'hui 

6.3.1. Morbidité et mortalité des infections à coronavirus, de leur émergence à nos jours 

6.4. Le système immunitaire et les infections à coronavirus 

6.4.1. Mécanismes immunologiques impliqués dans la réponse immunitaire au coronavirus 
6.4.2. Tempête de cytokines dans les infections à coronavirus et l'immunopathologie 
6.4.3. Modulation du système immunitaire dans les infections à coronavirus 

6.5. Pathogénie et Physiopathologie des infections par Coronavirus 

6.5.1. Altérations physiopathologiques et pathogéniques dans les infections à coronavirus 
6.5.2. Implications cliniques des principales altérations physiopathologiques 

6.6. Groupes à risque et mécanismes de transmission du coronavirus 

6.6.1. Principales caractéristiques socio-démographiques et épidémiologiques des groupes à risque touchés par les coronavirus 
6.6.2. Mécanismes de transmission du coronavirus 

6.7. Histoire naturelle des infections à coronavirus 

6.7.1. Stades de l'infection à coronavirus 

6.8. Mise à jour du diagnostic microbiologique des infections à coronavirus 

6.8.1. Collecte et soumission des échantillons 
6.8.2. PCR et séquençage 
6.8.3. Tests sérologiques 
6.8.4. Isolation virale 

6.9. Biosécurité actuelle dans les laboratoires de microbiologie pour la manipulation des échantillons de coronavirus 

6.9.1. Mesures de biosécurité pour la manipulation des échantillons de coronavirus 

6.10. Mise à jour de la gestion des infections à coronavirus 

6.10.1. Mesures préventives 
6.10.2. Traitement symptomatique 
6.10.3. Traitement antiviral et antimicrobien dans les infections à coronavirus 
6.10.4. Traitement des formes cliniques graves 

6.11. Défis futurs en matière de prévention, de diagnostic et de traitement des infections à coronavirus 

6.11.1. Défis mondiaux pour le développement de stratégies de prévention, de diagnostic et de traitement des infections à coronavirus 

Module 7. Infection par le VIH/SIDA 

7.1. Épidémiologie 

7.1.1. Morbidité au niveau mondial et par région géographique 
7.1.2. Mortalité au niveau mondial et par région géographique 
7.1.3. Principaux groupes vulnérables 

7.2. Aetiopathogénie 

7.2.1. Cycle de réplication virale 
7.2.2. La réponse immunitaire du VIH 
7.2.3. Sites sanctuaires 

7.3. Classifications cliniques utiles 

7.3.1. Stades cliniques de l'infection par le VIH 
7.3.2. Classification clinique et immunologique de l'infection par le VIH 

7.4. Manifestations cliniques en fonction des stades de la maladie 

7.4.1. Manifestations cliniques générales 
7.4.2. Manifestations cliniques par organes et systèmes 

7.5. Maladies opportunistes 

7.5.1. Maladies opportunistes mineures 
7.5.2. Principales maladies opportunistes 
7.5.3. Prophylaxie primaire des infections opportunistes 
7.5.4. Prophylaxie Secondaire des infections opportunistes 
7.5.5. Tumeurs chez le patient infecté par le VIH 

7.6. Diagnostic de l'infection par le VIH/SIDA 

7.6.1. Méthodes directes de détection du VIH 
7.6.2. Tests d'anticorps du VIH 

7.7. Traitement antirétroviral 

7.7.1. Critères de traitement antirétroviral 
7.7.2. Principaux médicaments antirétroviraux 
7.7.3. Suivi du traitement antirétroviral 
7.7.4. Échec du traitement antirétroviral 

7.8. Soins complets pour les personnes vivant avec le VIH/SIDA 

7.8.1. Modèle cubain de soins complets pour les personnes vivant avec le VIH 
7.8.2. Expériences mondiales et leadership de l'ONUSIDA dans la lutte contre le VIH/SIDA 

Module 8. Maladies bactériennes et antimicrobiens 

8.1. Principes de la bactériologie 

8.1.1. Concepts fondamentaux d'utilisation en bactériologie 
8.1.2. Principales bactéries gram-positives et leurs maladies 
8.1.3. Principales bactéries gram-négatives et leurs maladies 

8.2. Infections bactériennes de la peau 

8.2.1. Folliculite 
8.2.2. Furonculose 
8.2.3. Anthrax 
8.2.4. Abcès superficiels 
8.2.5. Erysipèle 

8.3. Pneumonie acquise dans la communauté 

8.3.1. Épidémiologie 
8.3.2. Étiologie 
8.3.3. Tableau clinique 
8.3.4. Diagnostic 
8.3.5. Échelles de pronostic 
8.3.6. Traitement 

8.4. Tuberculose 

8.4.1. Épidémiologie 
8.4.2. Aetiopathogénie 
8.4.3. Manifestations cliniques 
8.4.4. Classification 
8.4.5. Diagnostic 
8.4.6. Traitement 

8.5. Infections urinaires et gynécologiques chez la femme 

8.5.1. Classification 
8.5.2. Étiologie 
8.5.3. Tableau clinique 
8.5.4. Diagnostic 
8.5.5. Traitement 

8.6. Méningite bactérienne 

8.6.1. Immunologie de l'espace sous-arachnoïdien 
8.6.2. Étiologie 
8.6.3. Tableau clinique et complications 
8.6.4. Diagnostic 
8.6.5. Traitement 

8.7. Infections ostéo-articulaires 

8.7.1. Arthrite septique 
8.7.2. Ostéomyélite 
8.7.3. Myosite infectieuse 

8.8. Infections entériques et intra-abdominales 

8.8.1. Gastro-entérite aiguë 
8.8.2. Entérocolite aiguë 
8.8.3. Péritonite primaire 
8.8.4. Péritonite secondaire 

8.9. Zoonoses 

8.9.1. Concept 
8.9.2. Épidémiologie 
8.9.3. Principales zoonoses 
8.9.4. Leptospirose 

8.10. Antimicrobiens 

8.10.1. Concepts généraux 
8.10.2. Classifications 
8.10.3. Mécanismes d'action des antimicrobiens 

8.11. Bêta-lactamines: pénicillines et inhibiteurs de bêta-lactamase 

8.11.1. Structure du cycle bêta-lactame 
8.11.2. Pénicillines: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.11.3. Bêta-lactamases: types et action sur les bêta-lactamines 
8.11.4. Principaux inhibiteurs de bêta-lactamase 
8.11.5. Utilisations et indications thérapeutiques 
8.11.6. Céphalosporines 
8.11.7. Monobactames 
8.11.8. Carbapénèmes 

8.12. Aminoglycosides, Tétracyclines et Glycopeptides 

8.12.1. Aminoglycosides: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.12.2. Tétracyclines: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.12.3. Glycopeptides: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, dosage et présentation 

8.13. Lincosamides Rifamycines, Antifolates 

8.13.1. Lincosamides: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.13.2. Rifampacines: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.13.3. Antifolates: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 

8.14. Quinolones, Macrolides et Cétolides 

8.14.1. Quinolones: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.14.2. Macrolides: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 
8.14.3. Cétolides: classification, mécanismes d'action, spectre antimicrobien, pharmacocinétique, pharmacodynamique, posologie et présentation 

8.15. Nouveaux antibiotiques dans les infections à Gram positif (lipopeptides et oxazolidinones) 

8.15.1. Lipopeptides 
8.15.2. Oxazolidinones 

Module 9. Maladies fongiques 

9.1. Introduction à la mycologie et aux infections fongiques superficielles 

9.1.1. Concepts généraux utilisés en mycologie 
9.1.2. Caractéristiques fondamentales des champignons pathogènes 
9.1.3. Mycoses superficielles: épidermatophytose, tinea corporis, tinea capitis 

9.2. Infections fongiques profondes 

9.2.1. Mycoses profondes les plus courantes 
9.2.2. Principales manifestations cliniques des mycoses profondes 

9.3. Cryptococcose 

9.3.1. Épidémiologie 
9.3.2. Agent étiologique 
9.3.3. Pathogénie 
9.3.4. Tableau clinique 
9.3.5. Complications 
9.3.6. Diagnostic 
9.3.7. Traitement 

9.4. Histoplasmose 

9.4.1. Épidémiologie 
9.4.2. Agent étiologique 
9.4.3. Pathogénie 
9.4.4. Tableau clinique 
9.4.5. Complications 
9.4.6. Diagnostic 
9.4.7. Traitement 

9.5. Aspergillose 

9.5.1. Épidémiologie 
9.5.2. Agent étiologique 
9.5.3. Pathogénie 
9.5.4. Tableau clinique 
9.5.5. Complications 
9.5.6. Diagnostic 
9.5.7. Traitement 

9.6. Candidose systémique 

9.6.1. Épidémiologie 
9.6.2. Agent étiologique 
9.6.3. Pathogénie 
9.6.4. Tableau clinique 
9.6.5. Complications 
9.6.6. Diagnostic 
9.6.7. Traitement 

9.7. Coccidioidomycose 

9.7.1. Épidémiologie 
9.7.2. Agent étiologique 
9.7.3. Pathogénie 
9.7.4. Tableau clinique 
9.7.5. Complications 
9.7.6. Diagnostic 
9.7.7. Traitement 

9.8. Blastomycose 

9.8.1. Épidémiologie 
9.8.2. Agent étiologique 
9.8.3. Pathogénie 
9.8.4. Tableau clinique 
9.8.5. Complications 
9.8.6. Diagnostic 
9.8.7. Traitement 

9.9. Sporotrichose 

9.9.1. Épidémiologie 
9.9.2. Agent étiologique 
9.9.3. Pathogénie 
9.9.4. Tableau clinique 
9.9.5. Complications 
9.9.6. Diagnostic 
9.9.7. Traitement 

Module 10. Maladies parasitaires et tropicales 

10.1. Introduction à la parasitologie 

10.1.1. Concepts généraux utilisés en parasitologie 
10.1.2. Épidémiologie des principales parasitoses et maladies tropicales 
10.1.3. Classification des parasites 
10.1.4. Maladies tropicales et syndrome de la fièvre sous les tropiques 

10.2. Paludisme 

10.2.1. Épidémiologie 
10.2.2. Agent étiologique 
10.2.3. Pathogénie 
10.2.4. Tableau clinique 
10.2.5. Complications 
10.2.6. Diagnostic 
10.2.7. Traitement 

10.3. Maladies intestinales à protozoaires 

10.3.1. Principaux protozoaires intestinaux 
10.3.2. Diagnostic des protozoaires intestinaux 
10.3.3. Amibiase et giardiase 

10.4. Maladies filariennes 

10.4.1. Épidémiologie et situation mondiale 
10.4.2. Syndromes cliniques 
10.4.3. Filaires principales: Wuchereria bancrofti, Brugia malayi, Brugia timori, Onchocerca volvulus, Loa loa, Mansonella perstans, Mansonella streptocerca et Mansonella ozzardi

10.5. Leishmaniose 

10.5.1. Leishmaniose cutanée 
10.5.2. Leishmaniose profonde 

10.6. Trypanosomiase 

10.6.1. Trypanosomiase africaine 
10.6.2. Trypanosomiase américaine 

10.7. Schistosomiase 

10.7.1. Schistosoma haematobium 
10.7.2. Schistosoma mansoni 
10.7.3. Schistosoma japonicum 
10.7.4. Schistosoma intercalatum 

10.8. Parasitisme intestinal 

10.8.1. Épidémiologie 
10.8.2. Ascarose 
10.8.3. Oxyuriasis 
10.8.4. Ancylostomes et Nécatorioses 
10.8.5. Tricuriose 

10.9. Infections par ténias 

10.9.1. Les ténias intestinaux 
10.9.2. Ténias tissulaire 

10.10. Antiparasitaires 

10.10.1. Concepts généraux 
10.10.2. Principales définitions utilisées dans la gestion des vermifuges 
10.10.3. Classifications par: structure chimique, mécanisme d'action ou action antiparasitaires 
10.10.4. Mécanismes d'action 

10.11. Antiprotozoaires 

10.11.1. Classification 
10.11.2. Mécanismes d'action 
10.11.3. Spectre antiparasitaire 
10.11.4. Pharmacocinétique et pharmacodynamique 
10.11.5. Dosage et présentation 

10.12. Antiparasitaires pour helminthes 

10.12.1. Classification 
10.12.2. Mécanismes d'action 
10.12.3. Spectre antiparasitaire 
10.12.4. Pharmacocinétique et pharmacodynamique 
10.12.5. Dosage et présentation 

Module 11. Infections nosocomiales associées aux soins et à la sécurité des patients 

11.1. Épidémiologie des infections nosocomiales 

11.1.1. Infection du site opératoire par une connaissance approfondie de sa définition, de son épidémiologie, des germes les plus fréquents et de la conduite thérapeutique 
11.1.2. Pneumonies nosocomiales associées à la ventilation mécanique, en: Concepts généraux, l'épidémiologie, les facteurs de risque, l'étiologie, le diagnostic, la prévention et les antibiotiques les plus couramment utilisés 

11.2. Infection associée aux cathéters veineux périphériques et centraux non canalisés et aux cathéters urinaires 

11.2.1. Épidémiologie 
11.2.2. Étiologie 
11.2.3. Facteurs de risque 
11.2.4. Comportement en matière de diagnostic et de traitement 

11.3. Infection à Clostridium Difficile 

11.3.1. Épidémiologie 
11.3.2. Facteurs de risques 
11.3.3. Manifestations cliniques 
11.3.4. Diagnostic 
11.3.5. Traitement 

11.4. Aperçu de l'infection chez le patient gravement malade admis en Soins Intensifs 

11.4.1. Épidémiologie 
11.4.2. Facteurs de risque 
11.4.3. Étiologie 
11.4.4. Prévention 
11.4.5. Antibiotiques les plus utilisés 

11.5. Infections associées aux dispositifs utilisés en médecine 

11.5.1. Infection associée à un biofilm 
11.5.2. Infection des dispositifs utilisés en orthopédie 
11.5.3. Infection des dispositifs de chirurgie cardiovasculaire 
11.5.4. Infection dans les dispositifs neurochirurgicaux 
11.5.5. Infection des implants et des prothèses 

11.6. Mesures universelles de contrôle des infections nosocomiales 

11.6.1. Principales mesures recommandées au niveau international pour la lutte contre les infections nosocomiales 

11.7. Infections associées aux soins de santé 

11.7.1. Définition 
11.7.2. Épidémiologie 
11.7.3. Étiologie 
11.7.4. Antimicrobiens utilisés 

Module 12. Résistance aux antimicrobiens 

12.1. Épidémiologie. Du moléculaire au socio-économique 

12.1.1. Analyse de l'évolution moléculaire, génétique, clinique, épidémiologique et socio-économique de la résistance aux antimicrobiens 
12.1.2. Mortalité due aux superbactéries 
12.1.3. Les superbactéries les plus mortelles 

12.2. Mécanismes de la résistance aux antimicrobiens 

12.2.1. Mécanismes génétiques 
12.2.2. Mécanismes acquis 

12.3. MARSA y GISA 

12.3.1. Épidémiologie 
12.3.2. Mécanismes de résistance 
12.3.3. Alternatives de traitement 

12.4. Enterobacteriaceae résistants 

12.4.1. Épidémiologie 
12.4.2. Mécanismes de résistance 
12.4.3. Alternatives de traitement 

12.5. Pneumocoque résistant 

12.5.1. Épidémiologie 
12.5.2. Mécanismes de résistance 
12.5.3. Alternatives de traitement 

12.6. Résistance virale 

12.6.1. Épidémiologie 
12.6.2. Mécanismes de résistance 
12.6.3. Alternatives de traitement 

12.7. Résistance aux champignons et aux parasites 

12.7.1. Épidémiologie 
12.7.2. Mécanismes de résistance 
12.7.3. Alternatives de traitement 

12.8. Programme mondial de lutte contre la résistance aux antimicrobiens et de recherche de nouveaux antibiotiques 

12.8.1. Objectifs et actions du programme mondial de lutte contre la résistance aux antimicrobiens 
12.8.2. Recherche de nouveaux antibiotiques pour les germes multirésistants 
12.8.3. Émergence d'autres modalités thérapeutiques pour le contrôle des infections 

Module 13. L'utilisation correcte des antimicrobiens 

13.1. Principes de base de la sélection et de l'utilisation des antimicrobiens 

13.1.1. Éléments de l'antimicrobien 
13.1.2. Éléments germinaux 
13.1.3. Éléments de l'hôte 

13.2. Utilisation d’antimicrobiens dans des situations particulières à l’hôte 

13.2.1. Utilisation dans l'insuffisance rénale 
13.2.2. Utilisation pendant la grossesse 
13.2.3. Utilisation en cas d'insuffisance hépatique 

13.3. Le rôle des politiques et programmes d'utilisation rationnelle des antibiotiques et leur impact sur la résistance aux antimicrobiens et le coût des soins 

13.3.1. Situation des politiques et programmes d'utilisation rationnelle des antimicrobiens 
13.3.2. Impact des programmes et des politiques sur l'utilisation des antibiotiques 
13.3.3. Utilisation des directives de pratiques cliniques 

13.4. Les comités pharmacothérapeutiques comme outils de suivi et d'évaluation de l'utilisation des antibiotiques 

13.4.1. Structure 
13.4.2. Objectifs 
13.4.3. Fonctions 
13.4.4. Résultats de l'impact 

13.5. Prophylaxie antibiotique en chirurgie 

13.5.1. Classification des procédures chirurgicales 
13.5.2. Utilisations de la prophylaxie antibiotique selon le type d’intervention chirurgicale 
13.5.3. Programmes d'antibioprophylaxie les plus couramment utilisés en chirurgie 

13.6. Thérapeutique raisonnée dans l'utilisation des antibiotiques 

13.6.1. Les étapes de la thérapie raisonnée 
13.6.2. Importance d'une thérapeutique raisonnée 

13.7. Expérience mondiale en matière de contrôle de l'utilisation des antibiotiques 

13.7.1. Principales expériences mondiales en matière de contrôle de l'utilisation des antibiotiques 

Module 14. Le rôle de l'infectiologue dans les services de santé 

14.1. L'infectiologie et son importance pour les soins médicaux dans le domaine de toute spécialité 

14.1.1. L'universalité de la pathologie infectieuse dans les spécialités médicales 
14.1.2. La maîtrise de la thérapeutique antibiotique 

14.2. Compétences et aptitudes du pathologiste infectieux 

14.2.1. Compétences de l'infectiologue 
14.2.2. Compétences de l'infectiologue 

14.3. Rôles de l'infectiologue dans l'équipe soignante 

14.3.1. Rôles de l'infectiologue dans l'équipe de soins à différents niveaux du système de santé 

14.4. Interconsultation pour les maladies infectieuses 

14.4.1. Fonctions de la consultation en matière de maladies infectieuses 
14.4.2. Pathologies à consulter 

14.5. La mise à jour scientifique du médecin spécialiste des maladies infectieuses et les défis futurs de l'infectiologie 

14.5.1. Auto-préparation 
14.5.2. Formation et développement professionnel 
14.5.3. Les défis futurs des maladies infectieuses : avec l'émergence de nouvelles maladies, la résistance antimicrobienne et le développement de vaccins et d'antibiotiques

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